配有自動清洗系統的封膠機是通過耐酸泵執行清洗的，用戶只需要將清洗劑倒入機體內即可，無需單獨執行封膠機清洗流程，耐酸泵能應用多種高刺激性的清洗劑，所以不會對封膠機體產生影響，在清洗系統執行完畢后要將其中的殘膠廢水倒出，以免受到污水堆積影響。
　　操作人員需要嚴格按照封膠機清洗流程執行，才能確保設備的高效使用壽命，首先要將內部的殘留膠水完整排出，將輸膠管以及膠筒放入丙酮溶液中浸泡，除去多種殘膠廢液，然后使用清潔劑將封膠機機體附著的固化膠水以及灰塵異物全部除去，最后用潔凈布將清洗泡沫等完全除去并放置在干燥無塵環境中風干即可，使封膠機具備更高的使用壽命和執行效果。

　　需要注意的問題

　　采用人工完成封膠機清洗流程有著值得注意的問題，在執行之前需要將封膠機內部的脆弱零件取出，因為有的零件可能無法承受高刺激清洗劑的影響，嚴重的可能會使工作零件侵蝕失去效果，當然可以借此機會檢查零件正常工作狀況，如果有必要的話可以進行配件更換，然后使用干凈清潔布擦洗輸膠管道等易受粘膠侵蝕的地方即可。